2012年1月-2月为动员部署阶段。市政府召开动员大会，对鄱阳湖综合整治工作进行具体部署。明确责任单位和人员，深入湖区广泛宣传，公布举报电话、信箱，为整治行动顺利开展做好各项准备。2012年3月-10月为全面整治阶段。各有关县、区和市直部门展开专项整治，依法严厉查处各种违法行为，做到有举必查、查实必罚。2012年11月-12月为总结巩固阶段。市政府对综合整治进行全面总结，建立鄱阳湖保护的长效机制。

    方案对整治内容进行具体部署

    方案对整治内容进行了具体部署安排。针对非法捕捞的措施有：依法取缔非法捕捞工具，清理和销毁滞留水中定置渔具，严肃查处各类破坏渔业资源的违法案件。打击电、毒、炸鱼、非法使用定置网等破坏渔业资源的各类违法捕捞行为和破坏江豚等水生野生动物保护区环境的行为。加大渔船安全检查力度，打击渔船违章载客等非法生产与违规作业行为。

    在整治非法猎杀候鸟方面，打击非法猎杀、收购等各类违法行为；打击破坏越冬候鸟栖息地行为，全面清除危害候鸟安全的隐患等。在整治非法采砂方面，要做到减少作业采区，尽快妥善处理已批准的涉湖工程结合经营性采砂遗留问题。同时，减少作业时间，严格执行昼采夜停制度。此外，减少作业船舶数量并进行严格现场监管。

    方案在整治违法违规填湖方面下达了清理和整改任务。内容包括依法清理鄱阳湖水域内违反“两区一带”功能定位的开发建设项目，及擅自围湖造田、填湖造地等行为。对不符合功能定位的开发建设项目及不符合规划的农民建房必须积极整改恢复原状。有效清理废弃桥梁围堰、松木桩及湖床内的沉船、弃土弃渣等。在整治非法排污方面，提出控制新污染，治理老污染，开展环保专项行动三点要求。
   
    形成合力保卫鄱阳湖

    方案要求各有关县、区和市直部门需高度重视鄱阳湖综合整治，明确责任，密切配合，形成合力，共同参与跨部门、跨区域联合执法，增强专项行动打击实效。

    此次整治行动的目标为永保鄱阳湖“一湖清水”，使鄱阳湖水质稳定在Ⅲ类以上；湿地保护功能及生物多样性得到延伸；人类对鄱阳湖的开发利用更加科学合理，使鄱阳湖对长江中下游地区乃至全国、全世界生态安全、粮食安全、用水安全的支撑能力进一步增强。