中水投公司的前身是中国水利实业开发总公司，成立于1985年，是水利部直属企业。1997年12月26日更名改建为中国水利投资公司。

        2004年12月27日，经报请国务院同意，国家发改委印发了《国家发改委关于中国水利投资公司改革的意见的通知》（发改经体[2004]2993号），明确中水投公司“作为中央水利资产的投资主体和运营主体之一”。2004年12月28日，经报请国务院批准，国资委同意中国水利电力对外公司并入中水投公司作为全资子公司。2006年8月30日，公司在国家工商行政管理总局注册成立“国水投资集团”（简称国水投集团）。2006年10月31日经国务院国资委同意和国家工商行政管理总局核准，公司更名为“中国水利投资集团公司”。

        2007年2月13日国务院国资委以国资发规划〔2007〕40号文件明确我公司主业为投资与资产管理，即实业投资（水利水电、再生能源）与管理；工程承包；相关技术研究、贸易与服务。